SENYAWA ALAMI DAUN BAWANG UNTUK DIABETES: PENDEKATAN IN SILICO TERHADAP PPAR-γ
Abstrak
Daun bawang (Allium fistulosum L.) merupakan tanaman yang mengandung senyawa flavonoid dengan potensi aktivitas biologis yang beragam. Studi ini bertujuan untuk melihat interaksi yang stabil dari hasil docking antara struktur reseptor kompleks PPAR-γ dengan kandidat terbaik senyawa flavonoid pada daun bawang sebagai kandidat antidiabetes. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah metode kuantitatif dan dirancang dengan teknik penambatan molekul (Molecular Docking) berbasis komputasi yang dikenal sebagai molekuler dinamik (MD) mensimulasikan perilaku dinamis system molekuler sebagai fungsi waktu, memperlakukan setiap entitas dalam kotak simulasi (protein, ligan, atau air, jika ada) sebagai fleksibel. Hasil dari penambatan molekul pada 16 senyawa flavonoid daun bawang terdapat senyawa hesperidin yang memiliki energi bebas gibbs (ΔG) terkecil yaitu -10.0 kkal/mol yang mendekati ligan alami. Nilai RMSD dan RMSF yang cukup stabil. Senyawa hesperidin juga memiliki profil farmakokinetik yang baik dan tidak toksik sehingga memenuhi kriteria drug-likeness sebagai kandidat obat oral yang potensial. Temuan ini menunjukkan potensi pengembangan senyawa flavonoid, khususnya senyawa hesperidin dari daun bawang sebagai kandidat obat antidiabetes dengan menghambat reseptor PPARγ. Penelitian ini memberikan dasar bagi studi lanjutan secara in vitro dan in vivo untuk validasi aktivitas biologisnya.
Referensi
Akbar, N.A., Amin, S.,& Wulandari, W. T. (2022). Studi In Silico Senyawa yang Terkandung dalam Tanaman Daun Sirih Merah (Piper crocatum RUIZ & PAV) sebagai Kandidat Anti SARS CoV-2. Ejurnal Universitas Bth, 2, 378 391.
Amrulloh, L. S. W. F., Harmastuti, N., Prasetiyo, A., & Herowati, R. (2023). Analysis of Molecular Docking and Dynamics Simulation of Mahogany (Swietenia macrophylla King) Compounds Against the PLpro Enzyme SARS-COV-2. Jurnal Farmasi Dan Ilmu Kefarmasian Indonesia, 10(3), 347–359. https://doi.org/10.20473/jfiki.v10i32023.347-359
Anggraini, A. (2020). Manfaat Antioksidan Daun Salam Terhadap Kadar Glukosa Darah dan Penurunan Apoptosis Neuron di Hipocampus Otak tikus yang Mengalami Diabetes. Jurnal Medika Hutama, 2(1), 349–355. http://jurnalmedikahutama.com
Azzahra, A., Farhani, N., Syahfitri, W., & Fatahillah Pasaribu, S. (2022). Potensi Kandungan Flavonoid Dalam Kayu Bajakah Sebagai Antidiabetes. Jurnal Pendidik Tambusai, 6(2), 14345–14350.
Bare, Y., Helvina, M., Elizabeth, A., & Sari, D. R. T. (2019). Potensi Asam kafeat pada Kopi sebagai Simultan Gen Peroxixme Proliferator-Activated Receptor Gamma(PPAR-γ) Studi InSilico. Jurnal Saintek Lahan Kering, 2(2), 52–53.
Dinkes Provinsi Jawa Barat. (2023). Profil Kesehatan Jawa Barat 2023. Dinas Kesehatan Provinsi Jawa Barat, 1–294.
Febri, F. A., Putri, T. C. M., Salamah, A. F., & Wilapangga, A. (2023). Analisis Farmakokinetik dan Toksisitas Pada Kandungan Fenolik Ekstrak Daun Salam (Syzygium Polyanthum) Menggunakan In silico Pkcms Dan Protox II. Jurnal Bina Cipta Husada, 19(1), 108–117. http://tox.charite.de/protox_II/
Gaffar, S., Masyhuri, A. A., & Hartati, Y. W. (2016). Studi In silico Single Chain Variable Fragment (SCFV) Selektif Terhadap Hormon Basic Natriuretic Peptide (BNP). Chimica et Natura Acta, 4, 52–59. http://tcoffee.crg.cat
Guntarti, A., Yuningtyas, R., Susanti, H., & Zainab, Z. (2021). Penetapan Total Flavonoid dan Aktivitas Antioksidan Ekstrak Etanol Kubis Ungu (Brasicca Oleracea L. Var. Capitata F. Rubra) dan Kubis Putih (Brasicca Oleracea L. Var. Capitata F. Alba) dengan Metode DPPH (1,1-Difenil-2-Pikrilhidrazil). Jurnal Farmasi Ains Dan Praktis, 7(2), 135–143. http://journal.ummgl.ac.id/index.php/pharmacy
Hidayah, H., Ruswanto, R., Lestari, D., Amar, S., & Gunarti, N. (2024). Virtual Screening of Syzygium cumini (L.) Skeels Flavonoid Compounds as SARS-CoV-2 Main Protease Therapy Candidates. Jurnal Kimia Sains Dan Aplikasi, 27(7), 336–345.
International Diabetes Federation. IDF Diabetes Atlas, 11th edn. Brussels, Belgium: 2025. Available at: https://diabetesatlas.org
Komalasari, E., Susanti, & Mardianingrum, R. (2024). Uji In Silico Turunan Kuersetin Sebagai Penurun Kolesterol Ldl Dari Kulit Jeruk Manis (Citrus sinensis). Jurnal Penelitian Farmasi Indonesia, 13(1), 46–56. https://doi.org/10.51887/jpfi.v13i1.1851
Maharani, D. S., Gustia Redjeki, S., Emamia, E. S., Mulyadi, A. P. A., Nurviana, D., Aulifa, D. L., Amirah, S. R., & Karim, B. K. (2024). Identifikasi Senyawa Aktif Rimpang Kunyit (Curcuma longa L.) sebagai Kandidat Antikanker Melalui Studi In silico terhadap Reseptor Lymphocyte-Specific Protein Tyrosine Kinase. Chimica et Natura Acta, 12(1), 49–57. https://doi.org/10.24198/cna.v12.n1.49427
Mujtahid, I. F., Razak, R., & Najib, A. (2024). Studi In silico Prediksi Sifat Fisikokimia dan Toksisitas Senyawa Tectoquinone Sebagai α-Glukosidase inhibitor. Makassar Natural Product Journal, 2(3), 2024–2215. https://journal.farmasi.umi.ac.id/index.php/mnpj
Muñiz-Ramirez, A., Perez, R. M., Garcia, E., & Garcia, F. E. (2020). Antidiabetic Activity of Aloe vera Leaves. Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine, 2020. https://doi.org/10.1155/2020/6371201
Nguyen, T. L., & Kim, H. (2024). Immunoinformatics and Computational Approaches Driven Designing A Novel Vaccine Candidate Against Powassan Virus. Scientific Reports, 14(1), 1–15. https://doi.org/10.1038/s41598-024-56554-9
Nhlapho, S., Nyathi, M., Ngwenya, B., Dube, T., Telukdarie, A., Munien, I., Vermeulen, A., & Chude-Okonkwo, U. (2024). Druggability of Pharmaceutical Compounds Using Lipinski Rules with Machine Learning. Sciences of Pharmacy, 3(4), 177–192. https://doi.org/10.58920/sciphar0304264
Nursamsiar, N., Toding, A. T., & Awaluddin, A. (2016). Studi In silico Turunan Analog Kalkon dan Pirimidin Sebagai Antiinflamasi: Prediksi Absorpsi, Distribusi, dan Toksisitas. Pharmacy, 13(01), 92–100. http://www.chemaxon.com/
Nursanti, O., Aziz, A., & Hadisoebroto, G. (2022). Docking dan Uji oksisitas Secara Insilico untuk Mendapatkan Kandidat Obat Analgesik. INPHARNMED Journal (Indonesian Pharmacy and Natural Medicine Journal), 6(1), 35–46. https://doi.org/10.21927/inpharnmed.v6i1.1922
Ruswanto, R., Garna, I. M., Tuslinah, L., Mardianingrum, R., Lestari, T., & Nofianti, T. (2018). Kuersetin: Penghambat Uridin 5-Monofosfat Sintase Sebagai Kandidat Antikanker. Alchemy Jurnal Penelitian Kimia, 14(2), 236–252. https://doi.org/10.20961/alchemy.14.2.14396.236-254
Ruswanto, R., Rahayuningsih, N., Hidayati, N. L. D., Nuryani, G. S., & MArdianingrum, R. (2019). Uji In vitro dan Studi In silico Senyawa Turunan N’-Benzoylisonicotinohydrazide sebagai Kandidat Antituberkulosis. Jurnal Ilmu Kefarmasian Indonesia, 17(2), 218–226.
Sagitasa, S., Elizabeth, K., Sulaeman, L. I., Rafasafly, A., Syafra, D. W., Kristande, A., & Muchtaridi, M. (2021). Studi In silico Senyawa Aktif Daun Singawalang (Petiveria alliacea) Sebagai Penurun Kadar Glukosa Darah Untuk Pengobatan Penyakit Diabetes Melitus Tipe-2. Chimica et Natura Acta, 9(2), 58–66. https://doi.org/10.24198/cna.v9.n2.34083
Sari, B. L., Suhendar, U., & Hamdani, R. (2023). Penambatan dan Simulasi Dinamika Molekular Senyawa Bioaktif Tanaman Bawang Dayak (Eleutherine Sp.) Sebagai Inhibitor Kapsid Virus Hepatitis B. Pharmamedica Journal, 8(2), 103–110.
Sihotang, H. T. (2017). Perancangan Aplikasi Sistem Pakar Diagnosa Diabetes dengan Metode Bayes. Jurnal Mantik Penusa, 1(1), 2088–3943.
Suarta, I. M., Wardana, I. N. G., Hamidi, N., & Wijayanti, W. (2016). Pengaruh Ikatan Hydrogen Pada Hydrous Ethanol Terhadap Komposisi Azeotropik dan Kecepatan Pembakaran Laminar. In Seniati. Seniati.
Suherman, M., Prasetiawati, R., & Ramdani, D. (2020). Virtual Screening of Tamarind Active Compounds (Tamarindus indica L.) on Selective Inhibitor Siklooksigenase-2. Jurnal Ilmiah Farmako Bahari, 11(2), 125–136. http://PubChem.nbi.nlh.nih.gov
Sun, Q. (2022). The Hydrophobic Effects: Our Current Understanding. Molecules, 27(20), 1–27. https://doi.org/10.3390/molecules27207009
