STUDI IN SILICO SENYAWA TUMBUHAN FAMILI ASTERACEAE SEBAGAI PENGHAMBAT ENZIM XANTIN OXIDASE
DOI:
https://doi.org/10.36805/jpx.v7i2.2942Kata Kunci:
Asam urat, Asteraceae, Penambatan molekul, Xantin oksidaseAbstrak
Tumbuhan famili asteraceae mengandung senyawa flavonoid dan fenolik yang memiliki banyak manfaat diantaranya untuk menghambat enzim xantin oksidase, enzim ini berperan pada konversi purin menjadi asam urat. Produksi asam urat yang berlebihan didalam tubuh dapat menyebabkan pengendapan pada persendian yang menimbulkan rasa nyeri dan kaku serta terjadi pembengkakan pada sendi. Penghambatan terhadap enzim ini dapat menormalkan jumlah asam urat dalam tubuh dan mengurangi efek yang diakibatkannya. Penelitian ini bertujuan untuk melihat potensi tumbuhan famili asteraceae yang paling baik penghambatannya terhadap enzim xantin oksidase menggunakan metode in silico secara penambatan molekuler. Potensi senyawa dilihat berdasarkan parameter nilai energi ikatan, konstanta inhibisi, ikatan hidrogen, dan residu asam amino. Ukuran pusat penambatan molekul pada penelitian ini x = 95,226; y = 47,251; z = 112,78 dengan volume x, y, dan z = 40. Hasil simulasi menunjukkan senyawa uji yang memiliki nilai energi ikatan (ΔG) terbaik adalah mirisetin sebesar -10,58 kKal/mol. Secara umum dari hasil penelitian, senyawa mirisetin yang terdapat pada famili asteraceae tanaman bunga krisan merupakan senyawa yang berpotensi untuk diuji lebih lanjut secara in vitro atau in vivo sebagai penghambat enzim xantin oksidase.
Referensi
Alkandahri, M.Y., Patala, R., Berbudi, A., and Subarnas, A. Antimalarial Activity of Curcumin and Kaempferol Using Structure based Drug Design Method. Journal of Advanced Pharmacy Education and Research. 2021, 11(4): 86-90.
Amal, S., Gunarti, N.S., Lullael, K., Soebakti, K.P., Mahdalena, D.G., Fadhillah, N.N., dan Hidayah, H. Uji Aktivitas Antihiperurisemia Ekstrak Etanol beberapa Tumbuhan Famili Asteraceae. Majalah Farmasetika. 2021, 6(1); 32-41.
Bell, E.W., dan Zhang, Y. DockRMSD: an open-source tool for atom mapping and RMSD calculation of symmetric molecules through graph isomorphism. Journal of Cheminformatics. 2019, 11(1): 40-49.
Cao, H., Pauff, J.M., dan Hille, R. Substrate orientation and catalytic specificity in the action of xanthine oxidase: The sequential hydroxylation of hypoxanthine uric acid. Journal of biological chemistry. 2010, 285(36): 28044-28053.
Ernawati, E., dan Susanti, H. Penghambatan Aktivitas Xanthine Oxidase Oleh Ekstrak Etanol Sarang Semut (Myrmecodia tuberosa (Non Jack) Bl.) Secara In Vitro. Pharmaçiana. 2014, 4(1): 15-22.
Harris, M.D., Siegel, L.B., dan Alloway, J.A. Gout and Hyperuricemia. American Family Physician. 1999, 59(4): 925-934.
Hartanti, I.R., Putri, A.A., Auliya AS., Triadenda A.L., Laelasari, E., Suhandi, C., dan Muchtaridi, M. Molecular Docking Senyawa Xanton, Benzofenon, Dan Triterpenoid Sebagai Antidiabetes Dari Ekstrak Tumbuhan Garcinia Cowa. Jurnal Kimia. 2022, 16(1): 72-83.
Lingga, L. 2012. Bebas Penyakit Asam Urat Tanpa Obat. Jakarta: Agro Media Pustaka.
Mahendra, H.S., dan Arum, P. Pengaruh Pemberian Sari Buah Kersen terhadap Kadar Asam Urat pada Penderita Hiperurisemia. Jurnal Gizi. 2021, 10(1): 1-13.
Maiuolo, J., Oppedisano, F., Gratteri, S., Muscoli, C., dan Mollace, V. Regulation of uric acid metabolism and excretion. International Journal of Cardiology. 2016, 213 (14): 8-14.
McKee, D.L., Sternberg, A., Stange, U., Laufer, S., dan Naujokat, C. Candidate drugs against SARS-CoV-2 and COVID-19. Pharmacological Research. 2020, 157(7): 104859-104866.
Morris, G.M., Huey, R., Lindstrom, W., Sanner, M.F., Belew, R.K., Goodsell, D.S., dan Olson, A.J. AutoDock4 and AutoDockTools4: Automated docking with selective receptor flexibility. Journal of Computational Chemistry. 2009, 30(16): 2785-2791.
Mulatsari, E., Martati, T., Mumpuni, E., dan Dewi, N.L. In Silico Analysis of Antiviral Activity of Analog Curcumin Compounds. Jurnal Jamu Indonesia. 2020, 5(3): 114-121.
Okamoto, K., Eger, B.T., Nishino, T., Pai, E.F., dan Nishino, T. Mechanism of Inhibition of Xanthine Oxidoreductase by Allopurinol: Crystal Structure of Reduced Bovine Milk Xanthine Oxidoreductase Bound with Oxipurinol. Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids. 2008, 27(6): 888-893.
Prasetiawati, R., Suherman, M., Permana, B., dan Rahmawati, R. Molecular Docking Study of Anthocyanidin Compounds Against Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) as Anti-Lung Cancer. Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology. 2021, 8(1): 8-20.
Putra, T. R. 2009. Hiperurisemia. Dalam: Setiati, S., Sudoyo, A.W., Setiyohadi, B., Simadibrata, M., Syam, A.F, editor. Buku Ajar Ilmu Penyakit Dalam. Jilid III. Edisi V. Jakarta: Interna Publishing. Halaman 2055-2059.
Rena, S.R., Nurhidayah, N., dan Rustan, R. Analisis Molecular Docking Senyawa Garcinia Mangostana L Sebagai Kandidat Anti SARS-CoV-2. Jurnal Fisika Unand. 2022, 11(1): 82-88.
Rollando, R. Pendekatan Struktur Aktivitas dan Penambatan Molekul Senyawa 2-iminoethyl 2-(2-(1- hydroxypentan-2-yl) phenyl)acetate Hasil Isolasi Fungi Endofit Genus Fusarium sp pada Enzim β-ketoasil-ACP KasA Sintase dan Enzim Asam Mikolat Siklopropana Sintase. Pharmaceutical Journal of Indonesia. 2018, 3(2): 45-51.
Simanjuntak, H.A. Potensi Famili Asteraceae Sebagai Obat Tradisional Di Masyarakat Etnis Simalungun Kabupaten Simalungun Provinsi Sumatera Utara. BioLink (Jurnal Biologi Lingkungan, Industri, dan Kesehatan). 2017, 4(1): 11-18.
Umamaheswari, M., Prabhu, P., Asokkumar, K., Sivashanmugam, T., Subhadradevi, V., Jagannath, P., dan Madeswaran, A. In silico docking studies and in vitro xanthine oxidase inhibitory activity of commercially available terpenoids. International Journal of Phytopharmacy. 2012, 2(5): 135-142.
Wu, Y., Chang, K.Y., Lou, L., Edwards, L.G., Doma, B.K dan Xie, Z.R. In silico identification of drug candidates against COVID-19. Informatics in Medicine Unlocked. 2020, 21(4): 100461-100463.
